中德科学家霸占世界性难题：提醒甘薯来源前史

  我国以世界总栽培培育面积50%的土地出产了全球80％以上的甘薯，产值近亿吨。杂乱的遗传布景一直以来是限制甘薯研讨的瓶颈，甘薯来源问题悬而未决。8月21日，上海辰山植物园（中科院上海辰山植物科学研讨中心）和中国科学院上海植物生理生态研讨所联合德国马克斯普朗克分子遗传研讨所和分子植物生理研讨所的科研团队在世界闻名学术期刊《天然·植物》上一起宣布了提醒甘薯来源的重要论文，制作了甘薯基因组图谱。这是科学界在多倍体基因组学范畴取得的一项重大打破，也是上海辰山植物园开园七年以来在科研范畴取得的带有里程碑含义的打破，创始了多倍体杂乱基因组剖析的先河。

  上海辰山植物园杨俊博士为该论文的榜首作者。据杨俊博士介绍，甘薯基因组共有约4.4亿个碱基对，单组巨细在700M到800M之间。尽管近年来高通量测序技能一日千里，但解析多倍体基因组依然面临着巨大的妨碍。该研讨不只将绝大部分基因组序列定位到对应染色体上，还经过全新生物信息学办法，将六倍体的六组染色体分隔，然后提醒出：在甘薯的90条染色体中，有30条染色体来源于其二倍体先人种，别的60条染色体来源于其四倍体先人种；约50万年前，二倍体先人种和四倍体先人种之间的一次种间杂交孕育了今日的重要作物。这一发现处理了甘薯来源的谜题，为合理规划使用甘薯近源野生种供给了簇新的思路。

  世界甘薯基因组方案始于2014年，由上海辰山植物园（中科院上海辰山植物科学研讨中心）和中国科学院上海植物生理生态研讨所张鹏课题组一起建议，联合德国马克斯普朗克分子遗传研讨所和分子植物生理研讨所一起完成。该研讨充沛的发挥了多边合作优势，历时仅18个月，霸占了多倍体基因组拼装的世界性难题。该研讨采用了Illumina测序技能，自主开发了一套全新的多倍体单倍型化剖析软件，成功地制作了甘薯基因组的精密图。这为其它杂乱多倍体基因组测序供给了完善牢靠的战略与技能，将大力推进资源植物功用基因组学研讨的进程。